Aslen Dağıstanlı olan Yahya Efendinin hayatı hakkında yeterli bilgiye sahip değiliz. Ancak ailesinin diğer fertleri gibi onun da memleketinde oldukça önemli mevkilerde görev yapan bir zât olduğu kaydedilmektedir.[1]

Zâhirî ilimlere dair bazı âlimlerden dersler aldığı da zikredilmektedir. Daha sonra memleketindeki şeyhleri ziyaret ettiği ve bunların bir kısmından tasavvufî terbiye almaya başladığı da belirtilmektedir.

Seyyid Yahya Dağıstânî Hazretleri Hac vazifesini yerine getirmek üzere oğlu Halil Hamdi Paşa ile beraber yolculuk hazırlıklarına başladı. Bu sırada üzerinde her kimin hakkı varsa gelip talep etmesi için haber saldı. Herkese hakkını verip helâllik aldıktan sonra Hac yolculuğuna çıktı.

Uzun ve yorucu bir yolculuktan sonra ulaştığı Mekke’de bir vesileyle Abdullah Mekkî ile tanışıp sohbetlerine katıldı. Belli bir müddet devam eden bu alâkadar olmanın ardından oğluyla birlikte Abdullah Mekkî’ye intisap etti. Pek çok tasavvufî tecrübe yaşayarak gerçekleştirdiği seyr u sülûkünü tamamladıktan sonra irşad icazeti alarak burada kaldı.[2]

Yahya Efendinin zühd ehli bir sûfî olduğu kaydedilmektedir. Hatta onun Ahdullah Mekkî ile ilk tanışmasında bu yönü dolayısıyla tereddüt yaşadığı da belirtilmektedir. Abdullah Mekkî’nin evi Hz. Peygamber^(sav)’in evinin ve Kâbe’nin yakınında bulunmasına rağmen iki katlı olduğu için Yahya Efendi bu durumu önce saygısızlık olarak addetmiştir. Çünkü ona göre bir sûfînin evinin Kâbe’den yüksek olması edep açısından uygun değildi.

Yahya Efendinin bu tereddüt hâline vakıf olan Abdullah Mekkî Kâbe’nin yanında bulunduğu bir sırada onu yanına çağırdı. Yanına geldiğinde Abdullah Mekkî ona yönelerek şöyle dedi: Yahya Efendi bak bakalım bizim ev mi yüksek yoksa Kâbe mi?

Yahya Efendi baktı ki, Kâbe’nin yüksekliğinin sonu görünmüyor. Sonra hatasını fark edip şeyhinden özür diledi.

Yahya Efendinin doğum ve vefat tarihleri hakkında henüz kayıtlı bir bilgiye rastlanılamadı. Vefatından sonra Mekke’deki irşad vazifesini oğlu Halil Hamdi Paşa’ya bıraktı. Müslümanların yaşadığı değişik bölgelerde pek çok halifesi olduğu belirtilen Yahya Efendinin Anadolu’daki halifelerinden biri de Şiranlı Mustafa Efendi’dir.